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La plateforme génomique « GenΩmics »
Présentation
La plateforme de génomique, créée avec le soutien de la Région Ile-de-France, du Conseil Général des Yvelines, et de la Communauté d’agglomération de communes de Saint-Quentin-en-Yvelines, rassemble plusieurs équipements pour l’étude des acides nucléiques dans une perspective de biologie haut débit, qu’il s’agisse de les amplifier (appareils de qPCR), de les quantifier (LabChip DS), de les analyser et contrôler leur qualité (LabChip GX) ou de les séquencer (NextSeq 500 Illumina).
Nous sommes à votre disposition pour vous former à l’utilisation de ces appareils, ainsi que pour vous aider à interpréter les résultats de vos expériences.
Nous sommes à votre disposition pour vous former à l’utilisation de ces appareils, ainsi que pour vous aider à interpréter les résultats de vos expériences.
Équipements
- Séquenceur NextSeq 500 Illumina
- Bioruptor®
- LabCHIP DS
Software gratuit à disposition pour chaque poste d’analyse
- LabCHIP GX
Le résultat est transcrit numériquement. Outre la rapidité et la sensibilité, le LabChip GX présente l’avantage d’éviter de manipuler le BET. En revanche, il n'est pas possible d’y faire migrer des plasmides.
Software gratuit à disposition pour chaque poste d’analyse
- Appareils qPCR
Quatre appareils de PCR en temps réel, trois avec un bloc de 96 puits et un quatrième avec un bloc de 384 puits, sont disponibles sur la plateforme. Dotés de LEDs et de photodiodes pré-calibrées, leur système optique permet de multiplexer jusqu’à 5 fluorochromes et permet également les expériences de FRET.
Les trois appareils sont pilotés grâce à un écran tactile permettant de définir les protocoles de PCR, de suivre les amplifications en temps réel et de récupérer très facilement les résultats sur clé USB.
Un logiciel libre et particulièrement convivial, CFX Manager, permet d’analyser les données sur un ordinateur personnel.
Accès aux équipements
Les équipements de la plateforme sont accessibles à toute personne ayant fait la demande au personnel responsable de la plateforme. Chaque utilisateur doit lire et approuver la charte de la plateforme avant de profiter des équipements et services de la plateforme.
La réservation s’effectue directement en ligne pour les utilisateurs de l’UFR (possédant un identifiant UVSQ 4-4 ; il est nécessaire d’avoir au préalable validé ses identifiants et mot de passe, pour cela une simple connexion au site est suffisante) à l’adresse suivante : http://redmine.dsi.uvsq.fr/resa/schedule.php?scheduleid=sc150fd27328d252
Contacts
Département de Biotechnologie de la Santé DBS
Plateforme Génomique « GenΩmics »
UFR Simone Veil Santé
2 avenue de la source de la bièvre
78180 Montigny le Bretonneux
Responsable scientifique :
Henri-Jean Garchon
Tél. : (+33)1 70 42 94 70
henri-jean.garchon@inserm.fr
Responsable technique et opérationnel :
Hendrick Mambu-Mambueni
Tél. : (+33)1 70 42 94 66
hendrick.mambu-mambueni@uvsq.fr
Plateforme Génomique « GenΩmics »
UFR Simone Veil Santé
2 avenue de la source de la bièvre
78180 Montigny le Bretonneux
Responsable scientifique :
Henri-Jean Garchon
Tél. : (+33)1 70 42 94 70
henri-jean.garchon@inserm.fr
Responsable technique et opérationnel :
Hendrick Mambu-Mambueni
Tél. : (+33)1 70 42 94 66
hendrick.mambu-mambueni@uvsq.fr