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La plateforme de spectrométrie de masse
Présentation
La plateforme de spectrométrie MasSpecLab t de la Faculté de médecine (UFR Simone Veil - Santé) de l’UVSQ a été créée en 2013 avec le soutien de la Région Ile-de-France, du Conseil Général des Yvelines, et de la Communauté d’agglomération de communes de Saint-Quentin-en-Yvelines, et est intégrée dans le Département de Biotechnologie de la Santé de l’UVSQ. Les champs d’application de la spectrométrie de masse vont de l’analyse élémentaire (spectrométrie par torche à plasma ICP-MS) à l’analyse de macromolécules complexes telles que les protéines (protéomique), en passant par l’analyse des molécules de taille intermédiaire (métabolites cellulaires, médicaments, toxiques…). Les analyses peuvent être ciblées et ne concerner que quelques composés ou une famille de molécules, ou non ciblées (approches non biaisées de type métabolomique).
Les autres activités de la plateforme comprennent entre autres la détection et la quantification d’oligonucléotides de synthèse, d’endocannabinoïdes, de stéroides et de nombreux médicaments.
Accès aux équipements
Les équipements de la plateforme sont accessibles à toute personne ayant fait la demande au personnel responsable de la plateforme. Chaque utilisateur doit lire et approuver la charte de la plateforme avant de profiter des équipements et services de la plateforme.
Objectif
MasSpecLab propose aux équipes académiques et industrielles une expertise technique, biologique et médicale en spectrométrie de masse sous forme de collaborations ou de prestations de service.
Missions
- Assurer un rôle de conseil et interprétation dans les étapes pré-analytique
- Réaliser les analyses par spectrométrie à proprement parler
- Interpréter les résultats expérimentaux et de participer à l’innovation en développant des projets propres
Atouts
La plateforme dispose d’une large gamme de spectromètres de masse adaptés pour répondre aux besoins analytiques de projets de recherche en biologie et en médecine. Ces équipements et l’expertise de l’équipe permettent le développement de méthodes analytiques pour l’identification et la quantification des molécules d’intérêt, même présentes à très faible concentration ou dans des matrices non conventionnelles. La plateforme de spectrométrie développe une activité spécialisée de métabolomique, destinée à évaluer par une approche non biaisée l’expression du métabolome (ensemble des métabolites de faible masse moléculaire comme les lipides, les acides aminés, les acides organiques, les sucres, les nucléotides…) dans des tissus biologiques ou des micro-organismes. Cette activité de phénotypage moléculaire sera en particulier consacrée à la pharmacométabolomique, c’est-à-dire à l’étude de l’effet des médicaments sur le métabolisme et à l’identification de facteurs impliqués dans la réponse aux médicaments, mais la métabolomique permet également l’exploration de processus cellulaires (apotose, différenciation…) ou l’identification de biomarqueurs de pathologies.Les autres activités de la plateforme comprennent entre autres la détection et la quantification d’oligonucléotides de synthèse, d’endocannabinoïdes, de stéroides et de nombreux médicaments.
Accès aux équipements
Les équipements de la plateforme sont accessibles à toute personne ayant fait la demande au personnel responsable de la plateforme. Chaque utilisateur doit lire et approuver la charte de la plateforme avant de profiter des équipements et services de la plateforme.
Équipements
Les systèmes d'analyse comprennent les instruments suivants :
Ce spectromètre de masse est adapté pour l’analyse non ciblée ou ciblée de molécules avec une vaste gamme de masse moléculaire (de 50 à 6000 Da) dans des échantillons biologiques ou non biologiques, ainsi que pour l'analyse quantitative. Le Q-Exactive combine la sélection de précurseur haute performance grâce à l’analyseur quadripolaire et la haute résolution pour la détection des masses exactes (précision ? 5 ppm). Il est équipé d’une cellule de collision Higher-Energy Collisional Induced Dissociation (HCD) permettant l’acquisition de données spectrales MS/MS. Cet analyseur est couplé à une chaîne de chromatographie liquide U3000 et deux sources d’ionisation peuvent être employées : ionisation par electrospray (HESI) ou ionisation chimique à pression atmosphérique (APCI). Les applications typiques sont le profilage métabolomique à grande échelle, des screening non ciblés en recherche clinique ou en toxicologie médico-légale, l’analyse métabolique dans les premières phases de développement des médicaments, l’analyse structurale par détermination des masses exactes, l’analyse de principes actifs et/ou d'impuretés dans les médicaments ou poudres stupéfiantes ou l'analyse d'échantillons environnementaux.
par conductivité ICS-5000
L’ICS-5000 est un système de chromatographie ionique développé pour l'analyse des ions (anions et cations) ou des espèces très chargées. C’est le premier système de chromatographie ionique à haute pression sur le marché, ce qui permet des analyses rapides avec une grande résolution. Les principales applications sont la quantification des catécholamines, des acides aminés ou l’analyse des hydrates de carbone.
Pour les étapes pré-analytiques, la plateforme possède tous les équipements classiques requis pour la purification et la concentration des échantillons (hotte, évaporateurs, agitateurs rotatifs, centrifugeuses, four micro-ondes pour la minéralisation).
- Spectromètre à temps de vol couplé à la chromatographie gazeuse bidimensionnelle (GCxGC/TOF-MS Pegasus BT 4D)
- Hybride quadripôle –
Ce spectromètre de masse est adapté pour l’analyse non ciblée ou ciblée de molécules avec une vaste gamme de masse moléculaire (de 50 à 6000 Da) dans des échantillons biologiques ou non biologiques, ainsi que pour l'analyse quantitative. Le Q-Exactive combine la sélection de précurseur haute performance grâce à l’analyseur quadripolaire et la haute résolution pour la détection des masses exactes (précision ? 5 ppm). Il est équipé d’une cellule de collision Higher-Energy Collisional Induced Dissociation (HCD) permettant l’acquisition de données spectrales MS/MS. Cet analyseur est couplé à une chaîne de chromatographie liquide U3000 et deux sources d’ionisation peuvent être employées : ionisation par electrospray (HESI) ou ionisation chimique à pression atmosphérique (APCI). Les applications typiques sont le profilage métabolomique à grande échelle, des screening non ciblés en recherche clinique ou en toxicologie médico-légale, l’analyse métabolique dans les premières phases de développement des médicaments, l’analyse structurale par détermination des masses exactes, l’analyse de principes actifs et/ou d'impuretés dans les médicaments ou poudres stupéfiantes ou l'analyse d'échantillons environnementaux.
- Triple quadripôle Quantiva
- ICP-MS Element XR
- Système de chromatographie ionique
par conductivité ICS-5000
L’ICS-5000 est un système de chromatographie ionique développé pour l'analyse des ions (anions et cations) ou des espèces très chargées. C’est le premier système de chromatographie ionique à haute pression sur le marché, ce qui permet des analyses rapides avec une grande résolution. Les principales applications sont la quantification des catécholamines, des acides aminés ou l’analyse des hydrates de carbone.
Pour les étapes pré-analytiques, la plateforme possède tous les équipements classiques requis pour la purification et la concentration des échantillons (hotte, évaporateurs, agitateurs rotatifs, centrifugeuses, four micro-ondes pour la minéralisation).
Principe de fonctionnement
MasSpecLab propose ses services à des demandeurs institutionnels ou industriels.
Un premier contact doit être pris avec l’un des responsables de la plateforme qui donnera un accord de principe de participation au projet et transmettra au demandeur deux formulaires à compléter ci-dessous :
Un premier contact doit être pris avec l’un des responsables de la plateforme qui donnera un accord de principe de participation au projet et transmettra au demandeur deux formulaires à compléter ci-dessous :
- Formulaire de demande d’analyse : version française / English version
- Charte d’utilisation de la plateforme : version française / English version
Activité de conseil
Les responsables de la plateforme sont à la disposition des demandeurs pour les aider à l’optimisation des différentes étapes du processus :
- 1e étape : conseils pour la méthodologie expérimentale : Construction de la méthodologie expérimentale la plus adaptée pour l’analyse ultérieure des échantillons. Conseils sur la sélection des matrices à exploiter, la composition des milieux de culture, la nature des solvants employés, les formes chimiques des produits utilisés (sels ou bases) ainsi que sur les conditions d’échantillonnage et de conservation des prélèvements.
- 2e étape : phase pré-analytique : Développement du protocole approprié pour la purification et la concentration des échantillons. En effet, les molécules à analyser sont initialement dispersés dans leur matrice originelle (milieu de culture, sang ou autres milieux biologiques) et une étape de purification préalable (extraction liquide/liquide, extraction en phase solide, précipitation protéique…) est indispensable à toute méthode d’analyse par technique chromatographique afin de s’affranchir des interférences et d’obtenir une sensibilité analytique optimale.
- 3e étape : phase analytique : développement des méthodes analytiques, analyse qualitative et quantitative, utilisation des machines adaptée pour répondre à l’hypothèse scientifique, haute performance analytique offerte par la technologie Haute Résolution, démarche qualité pour garantir la performance des méthodes et l’exactitude des résultats.
- 4e étape : interprétation et analyse des résultats : aide à l’analyse scientifique en fonction des performances et limites des méthodes analytiques, rédaction des parties analytiques dans les publications.
Contact
Département de Biotechnologie de la Santé DBS
Plateforme de Spectrométrie de Masse « MasSpecLab »
UFR Simone Veil Santé
2 avenue de la source de la bièvre
78180 Montigny le Bretonneux
Responsables scientifiques :
Jean-Claude Alvarez / Stanislas Grassin delyle
Tél. : (+33)1 70 42 94 22
stanislas.grassin-delyle@uvsq.fr
jean-claude.alvarez@aphp.fr
Responsable technique et opérationnel :
Elodie Lamy
Tél. : (+33)1 70 42 95 40
elodie.lamy@uvsq.fr
Plateforme de Spectrométrie de Masse « MasSpecLab »
UFR Simone Veil Santé
2 avenue de la source de la bièvre
78180 Montigny le Bretonneux
Responsables scientifiques :
Jean-Claude Alvarez / Stanislas Grassin delyle
Tél. : (+33)1 70 42 94 22
stanislas.grassin-delyle@uvsq.fr
jean-claude.alvarez@aphp.fr
Responsable technique et opérationnel :
Elodie Lamy
Tél. : (+33)1 70 42 95 40
elodie.lamy@uvsq.fr